Общая вирусология с основами таксономии вирусов позвоночных
Введение
Вирусология наука о морфологии, физиологии, генетике, экологии и эволюции вирусов. Медицинская и ветеринарная вирусология исследует вирусы-паразиты человека и животных, их роль в этиологии и патогенезе инфекционных и опухолевых болезней, разрабатывает специальные методы диагностики, способы этиотропной терапии и специфической профилактики.
Вирусы являются одной из наиболее распространенных групп живых организмов, которые способны заражать не только практически всех представителей флоры и фауны, но и микроорганизмы. Эффективность борьбы со многими вирусами не имеет положительных результатов, так как вирусы не только имеют природный резервуар в окружающей среде, но и постоянно изменяются (мутируют), в связи с чем снижается эффективность проведения вакцинопрофилактики. Одним из наиболее ярких примеров является неэффективная многолетняя борьба с вирусом иммунодефицита человека.
Своевременность и точность постановки диагноза вирусного инфекционного заболевания позволяет не только осуществить эффективное лечение, направленное на уничтожение вирусного агента, но и провести профилактику дальнейшего распространения данного заболевания с учетом индивидуальных особенностей вириона. Например, в XX веке повсеместно было ликвидировано такое заболевание как оспа по средствам проведения массовой вакцинации населения.
В данном учебном пособии подробно рассмотрены вопросы основ классификации (таксономии) вирусов позвоночных, международный код классификации и номенклатуры вирусов, характеристики семейств и родов ДНК и РНК-содержащих вирусов, диагностики вирусных заболеваний и методы выделения и очистки вирусных препаратов.
Обозначения и сокращения
AGE агарозный гель
ANU Australian National University
ATCC American Type Culture Collection
bр (base pair) пара оснований
ds (double-stranded) двуспиральный
dsDNA двуспиральная ДНК
dsDNA-RT двуспиральная ДНК, в репликативном цикле которой имеется этап обратной транскрипции с РНК
dsRNA двуспиральная РНК
dsRNA двуспиральная РНК
G (GP) поверхностный гликопротеин
IN интеграза
IRES (internal ribosomal entry site) внутренний сайт входа рибосомы
kb (kilo base) килобаза (тысяча оснований)
kbp (kilo base pare) тысяча пар оснований
kDa (kilo Dalton) килодальтон
MA (matrix) матрикс
Mr (relative molar mass) относительная молярная масса
N (nucleoprotein) нуклеопротеин
NC (nucleocapsid) нуклеокапсид
NC (nucleocapsid) нуклеокапсид)
NNS негативный несегментированный геном РНК
NP нуклеопротеин
NS неструктурные белки это предшественники структурных белков, регуляторные белки и ферменты, обслуживающие процесс внутриклеточной репродукции вируса и не входящие в состав вирусной частицы
NSF National Science Foundation
NssRNA односпиральная РНК негативной полярности
nt (nucleotide) нуклеотид
ORF (open reading frame) открытая рамка считывания
PAGE полиакриламидный гель
PR протеаза
РrР приемный протеин
RT (reverse transcriptase) обратная транскриптаза
RT обратная транскриптаза
sgRNA (subgenomic RNA) субгеномная РНК
SH интегративный мембранный протеин
SP сериновая протеаза
ss (single-stranded) одноцепочечный
ssDNA односпиральная ДНК
ssRNA односпиральная РНК
ssRNA-RT односпиральная РНК в репликативном цикле которой имеется этап обратной транскрипции
SU (surface) поверхностный
T (triangular number) триангулярное число
VPg (genome-linked protein) геном-ассоциированный протеин
VP структурные белки, входящие в состав вирусной частицы
БСА альбумин нормальной сыворотки быка
ДНК дезоксирибонуклеиновая кислота
ИБ метод иммуноблотинга
ИД50 50 % инфекционная доза для животных или для куриных эмбрионов
иРНК информационная рибонуклеиновая кислота
ИФА иммунофлюоресцентный анализ
ИЭМ иммунная электронная микроскопия
ИЭТ изоэлектрическая точка
кДНК клеточная дезоксирибонуклеиновая кислота
КПЧ клетки почек человека
ЛД50 50 % смертельная доза
М матриксный протеин
ММГ методы молекулярной гибридизации
мРНК матричная рибонуклеиновая кислота
МФА метод иммунофлюоресценции
ПЦР полимеразная цепная реакция
ПЭГ полиэтиленгликоль
РБО реакция бляшкообразования
РВИЭФ реакция встречного иммуноэлектрофореза
РГА реакция гемагглютинации
РГАд реакции гемадсорбции
РЗБО реакция задержки (нейтрализации) бляшкообразования
РЗЦПД реакция задержки цитопатического действия вирусов
РИФ реакция иммунофлюоресценции
РН реакция нейтрализации
РНК рибонуклеиновая кислота
РРГ реакция радиального гемолиза
рРНК рибосомальная рибонуклеиновая кислота
РСК реакция связывания комплемента
РСР папаино-подобная цистеиновая протеаза
РТГА реакция торможения гемагглютинации
РТГАд реакция торможения гемадсорбции
СА (capsid protein) капсидный протеин
СР (capsid protein) капсидный протеин
СРЕ (cytopathic effect) ЦПЭ, цитопатический эффект
ТКИД50 50 % инфекционная доза для тканевой культуры
ТМ (transmembrane) трансмембранный
тРНК транспортная рибонуклеиновая кислота
УФ ультрафиолет
ФИТЦ флюоресцеина изотиоцианат
ФЭЧ фибробласты эмбриона человека
ЦПД цитопатическому действию
ЭМВ электронно-микроскопическое выявление