На обширных же просторах Сибири проживало много народностей, которые охотились на пушных зверей и пасли оленей. У них не существовало понятие «государство». Коренными жителями Хоккайдо, Сахалина, Курильских островов и островов Хабомаи, Шикотан, Кунашир и Итуруп были, в основном, айны и другие северные народности. Все эти народности, будучи поглощенными Японией или Россией, существуют и сейчас.
В международной практике не выработан единый механизм разрешения территориальных конфликтов между малыми народностями и «государством-поработитетлем». Если малые народности, объединившись, поднимаются на борьбу за независимость, в одних случаях им предоставляют независимость, в других случаях вырабатывается договоренность о расширении их автономии, а в третьих случаях дело кончается их истреблением. Какого-либо единого установленного принципа не существует.
Что касается начала установления взаимоотношений России и Японии, то первые контакты между японцами и русскими не были благоприятными. Начало их отношений приходится на вторую половину XVI века, когда Япония, завершив продолжительный период внутренних войн, в конце концов, была объединена Хидэёси Тоётоми (15361598).
Европейские государства в тот период, опираясь на превосходство военной техники, продвинулись в Азию, Африку и Америку и начали ожесточенное соперничество за приобретение колоний. Христианские миссионеры, будучи вовлечены в этот процесс, сыграли важную роль в борьбе за господство в колониях. Правительство Токугава, опасаясь оказаться под господством иноземного государства и иноземной религии, стало осуществлять политику изоляции страны. Прибытие и убытие иностранных кораблей было ограничено портом Нагасаки, а торговля почти полностью была монополизирована Нидерландами.
Правительство Токугава начало все более и более открыто проявлять опасения в отношении иностранцев, учитывая пример цинского Китая, кстати говоря, опережавшего Японию в историческом и культурном развитии. Когда европейские державы Великобритания, Франция и Россия, пренебрегая его суверенитетом, в XIX веке стали захватывать китайские территории, Китай стал терять свой суверенитет, стали попираться его национальные интересы. В это время японцы и столкнулись лицом к лицу с русскими, которые появились с севера.
Владимир Атласов встретился с потерпевшим кораблекрушение японцем по имени Дэмбэй, который был захвачен в плен коренными жителями на Камчатке. Император Петр I (16721725) пригласил его в Санкт-Петербург и, лично расспросив о Японии, назначил преподавателем и приказал учить русских детей японскому языку. Это произошло в 1702 г. Организовав экспедицию, российский император приступил к освоению пути к Японии со стороны Тихого океана.
В 1782 г. японский торговец Кодаю Дайкокуя (17511828) потерпел кораблекрушение и попал на остров Амчитка один из Алеутских островов. К. Дайкокуя был отправлен в Санкт-Петербург, где получил аудиенцию у императрицы Екатерины II (17291796). Императрица, стремясь установить торговые отношения с Японией, в 1792 г. направила в Японию миссию под началом Адама Лаксмана (17661796), который в качестве дара возвратил К. Дайкокуя на родину, предложив Японии завязать торговлю. Однако А. Лаксман, совершив плавание в Нэмуро, Мацумаэ и Хакодатэ, возвратился на родину, не достигнув поставленной цели. Голландцы выступили с наветом, сказав, что у России имеется замысел агрессии против Японии, и японское правительство, сославшись на закрытость страны, отказало российской миссии.
Россия не прекращала попытки наладить торговые и иные отношения с Японией: правительство России в 1803 г. снарядило в Японию миссию под началом Николая Петровича Резанова (17641807), но Резанов, по прибытии в Нагасаки, на полгода попал под строгий надзор. Ему отказали даже в приеме государственной грамоты и подарков. Видя такое непочтительное отношение, подчиненный Н.П.Резанова, капитан Николай Александрович Хвостов, пришел в ярость и стал в период с 1806 по 1807 гг. нападать на японские поселения и сторожевые посты на островах Сахалин, Итуруп и Рисири, поджигал дома и грабил население. Этот инцидент «отрезвил» японцев, которые, «закрыв» страну, пребывали в благодушном настроении, и породил вполне определенное чувство страха перед Россией.
Следующее столкновение Японии и России произошло в 1811 г., когда капитан военного корабля Диана Василий Михайлович Головнин (17761831) и восемь членов экипажа при обследовании местности во время своей высадки на остров Кунашир были захвачены в плен японскими чиновниками. После инцидента с Н.А. Хвостовым стража на острове Кунашир была усилена. В.М. Головнин и его подчиненные были под охраной доставлены в Хакодатэ и там заключены в тюрьму. Помощник капитана П.И. Рикорд, остававшийся на корабле, попытался освободить В.М. Головнина, но его попытка оказалась безрезультатной. В следующем году он задержал японское судно Касэ-мару и доставил его владельца, богатого купца Кахэй Такадая (17691827), в портовый город Петропавловск-Камчатский на полуострове Камчатка. Необычайная смелость и проницательность К.Такадая произвели большое впечатление на П.И. Рикорда. Между ними установились доверительные и дружеские отношения. В 1813 году корабль П.И. Рикорда с К. Такадая на борту появился в Мацумаэ. Благодаря самоотверженным усилиям К. Такадая, в конце концов, конфликт был исчерпан. После 26 месяцев пленения В.М. Головнин и его спутники, наконец, вернулись на родину. Написанные в 1846 году В.М. Головниным Записки в плену у японцев сразу же были переведены на английский, немецкий и французский языки и стали очень популярными. Хладнокровные наблюдения, записанные В.М. Головниным, внесли большой вклад в понимание специфики Японии.