На столице Германии сильно сказалась, длившаяся между 1618 и 1648 годами, Тридцатилетняя война: треть его домов была разрушена и половина жителей утеряна. В 1640 году от своего отца принял правление известный как Великий курфюрст Бранденбургский, Фридрих Вильгельм. В проводимой им политике было стимулирование иммиграции и высокая степень религиозной терпимости. Во второй год своего правления он основал пригороды Фридрихсвердер, Доротеенштадт и Фридрихштадт.
В 1671 году Фридрих Вильгельм предоставил убежище 500 еврейским семьям из Австрии. А Потсдамским эдиктом 1685 года пригласил в Бранденбург французских гугенотов. Данным предложением воспользовались более 15 тыс. французов, 6 тыс. из которых осели в Берлине. Около 1700 года выходцы из Франции составляли уже 20 % жителей Берлина, и ее культурное влияние в нем стало весьма значительным. В этом городе также уже было много иммигрантов из Богемии, Польши и Зальцбурга.
В 1701 году состоялась коронация Фридриха I (в городе Кенигсберге) в результате чего Берлин стал столицей королевства Пруссия. В 1709 году за этим последовало объединение городов Берлин, Келльн, Фридрихсвердер, Доротеенштадт и Фридрихштадт. Эти пригороды уже давно считались фактически частями Берлина.
9 октября 1760 года в ходе Семилетней войны 17561763 годов Берлин капитулировал перед 35-тысячными русско-австрийскими войсками под командованием саксонского графа Готтлоба Генриха фон Тотлебена, генерал-фельдмаршала графа Захария Григорьевича Чернышева и австрийского имперского фельдмаршала графа Франца Морица фон Ласси. Из 14 тыс. защищавших этот город солдат 4,5 тыс. было взято в плен. Помимо них, в качестве трофеев было получено 143 орудия, 18 тыс. ружей и пистолетов, 500 тыс. талеров контрибуции, разногласия при дележе которой стали причинами стычек между союзниками. Тогда это город подвергся также грабежам и поджогам, в основном со стороны австрийцев и саксонцев. Переданные городскими властями русскому генералу, символические ключи от Берлина сейчас хранятся в Казанском соборе Санкт-Петербурга. Через четыре дня после получения известия о приближении к Берлину основной прусской армии, русско-австрийские войска его покинули. По оценке магистрата этого города, общий ущерб от их пребывания в нем составил около 2 млн талеров.
14 октября 1806 года Пруссия потерпела сокрушительное поражение в битве с наполеоновскими войсками при Йене и Ауэрштедте. Оно побудило ее к реформам, ставшим решающими в ее дальнейшем развитии и давшим мощный толчок процессам в экономике и системе образования. В ноябре 1806 года в Берлин вошли французские войска под командованием Наполеона Бонапарта. 21(9) ноября 1806 года, находясь в нем, он объявил континентальную блокаду Англии. В феврале 1813 года русские войска во главе с генералами Михаилом Семеновичем Воронцовым, Фердинандом Федоровичем фон Винценгероде и Александром Ивановичем Чернышевым, преследуя остатки армии Наполеона, вторично заняли этот город. К 1861 году в состав Берлина вошли его новые пригороды Веддинг, Моабит, Темпельхоф, Шенеберг.
В 1871 году Берлин был провозглашен столицей новообразованной Германской империи.
По окончании Первой мировой войны, в результате Ноябрьской революции, в 1919 году в Германии была провозглашена Веймарская республика, однако официально, как и во времена монархии, немецкое государство продолжало именоваться «Германский рейх» (нем. Deutsches Reich).
В 1920 году был принят закон об образовании Большого Берлина, в результате чего границы германской столицы были расширены за счет присоединения к ней прилегавших городов и общин. Численность населения нового городского образования превысила 4 млн человек. Оно стало крупнейшим промышленным, научным и культурным центром Германии и евразийского континента.
После прихода к власти национал-социалистов в 1933 году Берлин стал столицей Третьего рейха.
В 1936 году в Берлине прошли XI летние Олимпийские игры, использованные нацистами для пропаганды своей идеологии.
В 19381939 годах под руководством Альберта Шпеера личного архитектора Гитлера и с 1937 года генерального строительного инспектора столицы нацистского Третьего рейха был разработан генеральный план реконструкции Берлина и его преобразования в будущую столицу мира под названием «Германия».
Во время Второй мировой войны большая часть Берлина была разрушена в результате многочисленных бомбардировок и уличных боев 1945 года. После взятия города Красной армией и капитуляции Германии Берлин, как и вся Германия, был разделен на четыре сектора под оккупационным управлением. Секторы США и Великобритании были образованы в западной части этого города, а сектор Советского Союза в восточной. 26 июля 1945 года появился французский сектор.
Противостояние западных союзников и СССР привело в 19481949 годах к экономической блокаде Западного Берлина, для преодоления которой его государствами-сторонниками был организован так называемый воздушный мост для снабжения этого города. В 1949 году оно привело к образованию на оккупированных территориях двух немецких государств: вначале Федеративной Республики Германии (ФРГ) в западной зоне, а следом за ней Германской Демократической Республики (ГДР) на востоке.
Западный Берлин стал «витриной Запада» городом с высокими уровнями жизни, социальной защиты и демократических свобод.
ФРГ своей временной столицей сделала город Бонн, а ГДР свою столицу разместила в Восточном Берлине. Усиление противостояния между советским и западным блоками на территории Берлина, а также значительный отток населения из Восточного Берлина, который только в июле 1961 года покинули 30 тыс. его жителей, привели в 1961 году к возведению социалистической ГДР Берлинской стены. Во время ее строительства в Западный Берлин бежали 85 военнослужащих и сотрудников служб безопасности, а также 400 гражданских лиц. С этого времени переход граждан между Западным и Восточным Берлинами допускался только через пограничные контрольно-пропускные пункты.
Правовой статус разделенного города урегулировало, подписанное в 1971 году, Четырехстороннее соглашение по Западному Берлину.
В начальный период разделения Берлина на две части, после 1949 года, примечательной чертой всех региональных проектов застройки этого города было практически полное игнорирование данной политической реалии архитекторами на западе и востоке. Соседние части городских территорий в этот период рассматривались в качестве объектов реализации единых по замыслу архитектурных проектов. «План использования территории Западного Берлина», неоднократно разрабатывавшийся в период 19651978 годов, в части разработки демографической гипотезы и предложений по развитию транспортной инфраструктуры охватывал всю территорию Большого Берлина. Лишь в разработанной в 1984 году новой редакции этого плана его проектные решения были жестко ориентированы на проблемы развития западной части города и практически не касались вопросов развития его восточной части или всего городского района в целом.
Аналогичная тенденция существовала в истории разработки генерального плана Восточного Берлина, который начал составляться в 1949 году и в связанном с ним «Плане пространственной организации территории Большого Берлина», разрабатывавшемся с 1955 года. Анализ и решения всех планировочных проблем касался единого городского района. На всю его территорию, а также на выделенную в ее пределах зону непосредственного тяготения Берлина в радиусе 30 км была разработана единая, рассчитанная на далекую перспективу концепция функционального использования урбанизируемого пространства, предусматривающая возможность расселения на нем не менее 4 млн человек. В соответствии с этой разработкой было предусмотрено резкое повышение уровня интенсивности использования селитебных и промышленных территорий при сохранении, предназначенных для сельскохозяйственного и рекреационного использования, больших незастроенных пространств.