Из-за разрушения Манасского канала, долгое время Кашкадаринский бассейн не получал воду из Зеравшана. Но, в архивных материалах существуют документы, свидетельствующие о восстановлении канала в эпоху правления Амира Темура (14 век).
Когда советские ученые изучили древнее русло Манасского канала, они обнаружили, что он представляет собой нынешний канал Эски анхор. В архивных материалах также можно найти следующую информацию: около 650 лет назад, Кашкадаринцы приходили в кишлак Джом недалеко от Самарканда, чистили канал Эски (Старый) анхор и после работы устраивали праздник.32
Следует особенно отметить, что в это время строительство и использование оросительных систем осуществлялось на основании инженерных расчетов. В строительстве каналов чувствует участие средневековых ученых. Строительство каждого отдельно взятого водного сооружения осуществлялось на основании точных проектных программ. И этим увеличивалась степень производительности орошения.
Высокий уровень развития искусства зодчества и строительства в Средней Азии в средние века также ярко выражается в сооружениях водного хозяйства того времени. Свидетельством нашего заключения является строительство гидротехнических сооружений из жженого кирпича и эластичного раствора. Даже в наше время можно встретить некоторые остатки таких узловых пунктов, мостов распределения воды и водных объектов. Среди них остатки моста и узлового пункта в Сурхандарье, дамбы Хонбанди в Джизакской области и дамбы Абдуллахон банди в Самаркандской области, моста распределения воды на реке Зарафшан.
Русскими ученые собрали так много ценных документов и материалов, которые свидетельствуют о несравненном опыте местного населения в искусственном орошении. Известный русский ирригатор А. Ф. Миддендорф знакомился ирригацией Ферганской долины и писал следующее: « В первую очередь, нам необходимо стать учениками туземцев, у кого есть проверенный тысячелетиями опыт, богатый достижениями».33
Проживший долгое время в Фергане русский специалист В. М. Кушевский также изложил свои впечатления об ирригации долины: «Нельзя не восхищаться способностью людей без технических знаний вести воду в свои посевные площади, где очень много крутых холмов. Приводит в чрезмерный восторг то, что вся эта работа выполнялась без знаний и инструментов».34
В конце XIX начале XX веков были поставлены первые шаги для освоения Мирзачуля. Именно в этот период были построены два крупных канала «Николай-1», ныне Л-3, и «Романовский». Организатором строительства этих двух каналов35 был Российский князь Н. К. Романов. Сразу после завершения строительства этих двух каналов, начали переселять людей в северную часть Мирзачуля. В том числе, часть населения была перевезена из России.
Один из незавершенных в то время проектов было сооружение канала для направления воды Амударьи в Бухару, которое было остановлено после перехода оазиса Самарканд под управление Туркестанской Администрации. Осуществления этой идеи мыслителя того времени Ахмада Даниша было сложным делом. Так как Царская Россия была заинтересована тратить в Бухаре как можно меньше средств, и получать как можно больше прибыли. Хотя и Бухарские правители оставили предложение и чертежи Ахмада Даниша без внимания, его работа очень важна в истории водоснабжения Бухары, в частности в строительстве канала Аму-Бухара.
Расширение орошаемых земель в оазисе Самарканда, дальнейшее осложнение проблемы распределения воды, остановка работ по расширению орошаемых земель в Зеравшанском округе вынудило правителей Зеравшанского округа принять идею переброски вод Амударьи в сторону Бухары и использовать ее для освоения новых земель в оазисе Самарканда.
После этого, начиная с 1880 года, был разработан ряд научных предложений и проектов и проведены изыскания. Начиная с 1910 года, Отдел Губернаторства по Приведению Состояния Земель в Порядок приступил к изыскательской работе. Было выполнено 12 изыскательский кампаний. Для выполнения этих работ в течение 19011916 гг., было выделено 8 миллионов 87 тысяч 448 рублей. На основании данных экспедиции 19122916 годов А. В. Чаплыгин разработал проект приведения водного хозяйства Зеравшанской долины в порядок, и в данном проекте предусматривалось механическая переброска вод Амударьи в оазис Бухары36 и часть вод реки Зарафшан направить в оазис Кашкадарьи для открытия новых земель.